MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 7356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
2	NC_018618	GT	3	6	42	47	0 %	50 %	50 %	0 %	407453020
3	NC_018618	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
4	NC_018618	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
5	NC_018618	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
6	NC_018618	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
7	NC_018618	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
8	NC_018618	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
9	NC_018618	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453020
10	NC_018618	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
11	NC_018618	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
12	NC_018618	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
13	NC_018618	TAAT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
14	NC_018618	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453020
15	NC_018618	A	7	7	562	568	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
16	NC_018618	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
17	NC_018618	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
18	NC_018618	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	407453020
19	NC_018618	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453020
20	NC_018618	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
21	NC_018618	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
22	NC_018618	TA	3	6	715	720	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
23	NC_018618	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
24	NC_018618	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453020
25	NC_018618	TA	3	6	853	858	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
26	NC_018618	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453020
27	NC_018618	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
28	NC_018618	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
29	NC_018618	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
30	NC_018618	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
31	NC_018618	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
32	NC_018618	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
33	NC_018618	A	8	8	1049	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
34	NC_018618	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	407453020
35	NC_018618	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
36	NC_018618	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453020
37	NC_018618	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
38	NC_018618	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
39	NC_018618	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
40	NC_018618	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
41	NC_018618	A	7	7	1261	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
42	NC_018618	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	407453020
43	NC_018618	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
44	NC_018618	GAAA	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	407453020
45	NC_018618	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
46	NC_018618	AAAT	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	407453020
47	NC_018618	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407453020
48	NC_018618	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453020
49	NC_018618	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
50	NC_018618	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
51	NC_018618	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
52	NC_018618	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	407453020
53	NC_018618	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
54	NC_018618	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
55	NC_018618	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
56	NC_018618	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
57	NC_018618	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
58	NC_018618	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
59	NC_018618	TAAT	2	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
60	NC_018618	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
61	NC_018618	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
62	NC_018618	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
63	NC_018618	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
64	NC_018618	AT	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	407453020
65	NC_018618	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
66	NC_018618	A	8	8	1805	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
67	NC_018618	A	7	7	1841	1847	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
68	NC_018618	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453020
69	NC_018618	A	6	6	1867	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	407453020
70	NC_018618	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453020
71	NC_018618	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
72	NC_018618	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
73	NC_018618	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453021
74	NC_018618	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
75	NC_018618	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453021
76	NC_018618	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	407453021
77	NC_018618	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453021
78	NC_018618	TC	3	6	2109	2114	0 %	50 %	0 %	50 %	407453021
79	NC_018618	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	407453021
80	NC_018618	CA	3	6	2173	2178	50 %	0 %	0 %	50 %	407453021
81	NC_018618	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
82	NC_018618	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
83	NC_018618	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453021
84	NC_018618	T	8	8	2457	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	407453021
85	NC_018618	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453021
86	NC_018618	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453021
87	NC_018618	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453021
88	NC_018618	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407453021
89	NC_018618	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453021
90	NC_018618	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453021
91	NC_018618	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
92	NC_018618	ATAA	2	8	4385	4392	75 %	25 %	0 %	0 %	407453022
93	NC_018618	AGATAA	2	12	4393	4404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453022
94	NC_018618	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
95	NC_018618	GTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453022
96	NC_018618	T	6	6	4447	4452	0 %	100 %	0 %	0 %	407453022
97	NC_018618	AT	3	6	4463	4468	50 %	50 %	0 %	0 %	407453022
98	NC_018618	ATT	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
99	NC_018618	ATA	3	9	4489	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
100	NC_018618	CCTATA	2	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453022
101	NC_018618	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	407453022
102	NC_018618	CTG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453022
103	NC_018618	AAC	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453022
104	NC_018618	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
105	NC_018618	GTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453022
106	NC_018618	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
107	NC_018618	TGCATT	2	12	4793	4804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407453022
108	NC_018618	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
109	NC_018618	GTAA	2	8	4817	4824	50 %	25 %	25 %	0 %	407453022
110	NC_018618	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
111	NC_018618	AGTA	2	8	4927	4934	50 %	25 %	25 %	0 %	407453022
112	NC_018618	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
113	NC_018618	A	6	6	4943	4948	100 %	0 %	0 %	0 %	407453022
114	NC_018618	TAT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
115	NC_018618	AGT	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453022
116	NC_018618	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453022
117	NC_018618	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
118	NC_018618	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
119	NC_018618	ATA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
120	NC_018618	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	407453022
121	NC_018618	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453022
122	NC_018618	AT	3	6	5261	5266	50 %	50 %	0 %	0 %	407453022
123	NC_018618	TAAA	2	8	5314	5321	75 %	25 %	0 %	0 %	407453022
124	NC_018618	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
125	NC_018618	AAAG	2	8	5365	5372	75 %	0 %	25 %	0 %	407453022
126	NC_018618	TAA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
127	NC_018618	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
128	NC_018618	CTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453022
129	NC_018618	TTTA	2	8	5449	5456	25 %	75 %	0 %	0 %	407453022
130	NC_018618	A	6	6	5469	5474	100 %	0 %	0 %	0 %	407453022
131	NC_018618	ATTAAA	2	12	5495	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
132	NC_018618	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
133	NC_018618	TATC	2	8	5529	5536	25 %	50 %	0 %	25 %	407453022
134	NC_018618	ATT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
135	NC_018618	ATAAA	2	10	5548	5557	80 %	20 %	0 %	0 %	407453022
136	NC_018618	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
137	NC_018618	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
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265	NC_018618	CTAG	2	8	9015	9022	25 %	25 %	25 %	25 %	407453024
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